治疗肛周湿疹的药膏有很多，有中药的药膏，有西药的药膏。在用药方面通常可以外擦、内服相结合，外擦的一般是使用一些含有抗真菌药物，联合糖皮质激素的复方软膏治疗，比如派瑞松霜、复方咪康唑霜等。再就是可以使用一些清热燥湿、止痒的中成药坐浴或者是熏洗，比如甘霖洗剂、复方黄柏液、皮肤康洗液等，对于肛周湿疹都有一定的治疗作用。在治疗方面，对肛周湿疹通常要综合性的治疗，包括饮食清淡、局部搞好清洁卫生、衣物宽松透气。
湿疹是由内、外多种因素所诱发的变态反应性皮肤炎症。长在肛门周围的湿疹，往往与局部的潮湿多汗、清洁卫生不到位或者内裤等的摩擦刺激都有关系。