一般来讲，梅毒和生殖器疱疹比较，还是梅毒相对要严重一些。
梅毒是由梅毒螺旋体感染所引起的一种慢性、全身性的性传播疾病。梅毒如果不及时治疗的话，它可以造成皮肤黏膜，还有内脏器官严重的损害，到了晚期可以破坏心血管，还有神经系统，造成一些不可逆的破坏。但是，它的好处就是有特效的药物可以进行治疗，它对青霉素高度敏感，所以早期治疗可以实现根治。
生殖器疱疹是由单纯疱疹病毒感染所引起来的一种性传播疾病，病变主要是局限在生殖器部位，出现水疱、灼痛，很少引起内脏器官的损伤。所以从危害程度上来讲并不算是特别严重，但是生殖器疱疹，难点就是容易复发。如果病毒能够潜伏在局部的神经节内，每次当机体免疫下降的时候就容易复发，虽然有抗病毒的药物可以治疗生殖器疱疹，但是往往只能控制症状，难以去根。所以从治疗方面讲，生殖器疱疹相对梅毒要难治一些。