儿童抽动症的治疗包括心理行为治疗和药物治疗，要注重治疗的个体化。
心理行为治疗主要是健康教育，针对儿童、父母、老师及其他跟儿童有较多接触的人员，告知抽动症是一种行为障碍性疾病，是儿童无法控制的，并非品行问题，不要过分的关注儿童的抽动症状。针对抽动症的药物治疗，一类为抗精神的药物，现在常用的为利培酮。还有一类为中枢性α肾上腺素能受体激动剂，治疗轻至中度抽动症的一线用药，推荐作为首选，可选择可乐定。还有作用于γ-氨基丁酸系统的药物，如氯硝西泮、丙戊酸钠，也有较好的疗效。
抽动症的病因目前还没有完全明确，近年的研究提示它的发展可能与遗传因素，神经生理、神经生化、心理因素，和环境因素等诸多方面有关，为多种因素在发育过程当中相互作用所导致的结果。