儿童病毒性脑膜炎早期症状表现为发热，热型不定，可低热或者高热。大孩子会叫头痛，小的孩子不会叫头痛，但表现为精神萎靡或者烦躁不安或者尖叫，或者前囟隆起张力增高，有上呼吸道感染的症状像咳嗽、流鼻涕、鼻塞等。
如果是单纯疱疹病毒感染引起的脑炎，可伴有口唇或角膜疱疹。柯萨奇病毒感染引起的脑炎，可伴有心肌炎和各种类型的皮疹。肠道病毒71型脑炎可伴有手足口病或者疱疹性咽峡炎。
另外，还有恶心、呕吐、腹痛、肌肉痛等症状。严重的还会出现抽搐，可有脑膜刺激征，可以行腰穿脑脊液常规、生化、细胞学分类来检查，明确诊断。