针对尿道炎治疗的本身，需要根据尿细菌培养的结果，选用敏感的抗生素，并且要足够疗程，一般要一到两个礼拜，同时还要求患者注意个人清洁卫生，大量饮水，并对上述各类的危险因素加以控制和缓解，方可以使得尿道炎比较好治疗，同时也可以减少复发的概率。
慢性尿道炎的治疗基本上是使用抗生素，但是尿道炎往往都是急性的，这种反复发作的尿道炎的确可称之为慢性尿道炎，但是在临床中比例不高，往往见于有一些危险因素的患者，例如老年，还有免疫力低下。长期使用糖皮质激素或者是免疫制剂，以及不注意个人清洁卫生，肿瘤恶液质，长期营养不良，糖尿病血糖控制不好，长期留置导尿或者膀胱造瘘等情况。