大拇指指甲凹陷进去的原因有很多，包括有缺铁性贫血、甲真菌病、甲营养不良，银屑病、扁平苔藓等炎症性疾病，也可能造成甲凹凸不平。
如果是缺铁性贫血造成的，需要到医院进行相关的检查，补充铁剂使缺血性贫血恢复，那么甲也就恢复正常。如果是甲真菌病造成的，需要使用一些外涂以及口服抗真菌类的药物，当真菌清除之后，甲也就能够恢复正常。如果是因为，甲营养不良造成的凹凸不平，可以补充适量的维生素，以及微量元素，让甲恢复到正常营养，也就能够恢复正常。如果是银屑病，或者是扁平苔癣等炎症性疾病，造成的甲凹凸不平，局部可能是需要使用一些糖皮质激素类的药物，来进行对症处理。