输卵管结石如果没有引起泌尿系感染，是不需要吃消炎药的。如果通过尿常规等检查，证实了存在泌尿系的感染，则可以吃一些抗生素。主要的原因是由于输尿管结石梗阻导致了尿液排不出，有细菌在体内繁殖，形成感染，一般选用的是头孢三代或者是喹诺酮三代的药物，可以口服。如果比较严重，则需要静脉输入，最好还是根据血或者是尿细菌培养的结果，来选择相对敏感的抗生素。
对于输尿管结石，如果小于六毫米，患者没有病理性的输尿管狭窄，可以采取药物排石和抗生素同时服用，常用的药物有坦索罗辛、硝苯地平等，可以很好的扩张输尿管促进排石；除此之外，还要配合大量饮水，保持每日饮水量在两千五百毫升左右，就可以有足够大的尿量去冲刷尿道，来促进结石排出。