肛周皮肤湿疹在治疗方面，可以口服抗组胺药物，比如像氯雷他定、西替利嗪等抗过敏止痒。另外可以辅助一些清热燥湿的中成药来进行治疗，在外用药方面，可以用含有糖皮质激素的药膏，比如像派瑞松霜、复方咪康唑霜等等。如果肛周湿疹处在急性期，局部有渗液、流水，可以先用硼酸液或者是稀的高锰酸钾溶液，做局部的湿敷，等皮损干燥之后，再改用乳膏制剂。另外像一些中成药膏，比如像苦参凝胶、青鹏软膏等等，对肛周湿疹也是有治疗效果的。还有一些中药的洗剂，比如像甘霖洗剂、复方黄柏液等等，可以稀释以后来外洗或者是坐浴，对肛周的湿疹也是有治疗作用。
肛周皮肤湿疹诱发的变态反应性的皮肤炎症，通常是伴有明显的瘙痒。