如果是偶尔发生的腋部毛囊炎，数量也不多，就可以外擦碘伏或者是百多邦软膏，夫西地酸乳膏等进行治疗。如果是腋下长期反复发作毛囊炎，数量也比较多，就可以加用口服的抗菌药物治疗，比如头孢类、大环内酯类抗菌素，喹诺酮类等抗菌素，都是可以的。需要注意的就是疗程要足够，否则停药过早，毛囊炎可能就容易复发。
腋下毛囊炎主要是腋窝部的细菌感染所引起的，具体引起的原因，可能与腋窝局部潮湿多汗，清洁卫生不够有关系，与机体自身免疫状态也有一定的关系。所以，治疗腋下毛囊炎，要注意饮食清淡，少吃辛辣、刺激的食物，要保证腋部的清洁卫生，平时要勤洗勤扑粉，保持皮肤干爽。