甲胎蛋白正常值应该小于二十五微克每升，一般在慢性的乙肝、肝硬化的病人，大于两百微克每升。大于两百微克每升的时候也是高度怀疑有合并肝癌的可能，如果患者合并肿瘤的时候，AFP大于四百微克每升，结合影像学诊断的依据。大于一千微克每升，诊断为肝癌的可能性会更大，轻度升高往往没有任何临床意义。
甲胎蛋白与肝癌以及多种肿瘤的发生、发展是密切相关的，在多种肿瘤中都可以表现为比较高的浓度，可以作为很多种肿瘤的阳性检测的指标。目前甲胎蛋白在临床上主要作为肝癌的血清标志物，用于原发性肝癌的诊断以及疗效监测。甲胎蛋白的意义，在儿童期血清甲胎蛋白的含量升高，主要可能与肝脏的肿瘤、肝母细胞瘤、性腺畸胎母细胞瘤、肝炎等相关，甲胎蛋白含量会出现升高。