药物一般不会引起牙龈肿痛，但是有些治疗全身性疾病的药物，如头孢菌素A，苯妥英钠等，可能会引起牙龈的增生。牙龈肿痛后可以使用一些微量元素以及维生素，清热去火的药物进行治疗。这些药物具有比较好的抗氧化作用，以及促进局部黏膜修复的作用。在牙龈肿痛后使用维生素类的药物，还具有一定的治疗作用。
发生牙龈肿胀后，可以使用一些具有抗炎作用的漱口水，如新洁尔灭，双氧水。这些灭菌药物都能很好的杀灭继存在牙龈周围的细菌，起到控制、治疗炎症的作用。另外口服甲硝唑、强力霉素等抗生素药物，都具有很好的效果。但是这些药物都具有一定的副作用，一定要在医生的指导下进行使用。