肛门附近有个小疙瘩可以有多种原因，比较常见的首先是痔疮，比如外痔，是局部结缔组织增生，经常在肛门外缘就会形成一些小的突起，质地比较软，急性发作的时候就会变硬，有时候还会形成血栓性的外痔，所以痔疮是最常见的。当然还有其他的疾病，比如肛周的尖锐湿疣，是一种性传播疾病，一般是在不洁的性行为、性接触之后，经过一段时间的潜伏期，在局部就会形成疣状的皮肤赘生物，就是肛周的尖锐湿疣。
另外还有像肛瘘，肛瘘破溃的外口部位也会形成一个小疙瘩，时常有一些脓液从其中排出。所以肛周小疙瘩是由很多疾病引起的，包括普通的外痔，也包括一些特殊的性传播疾病，比如尖锐湿疣。