阴茎癌的病因可能和患者抽烟，没有做好局部的清洁卫生以及性生活不固定，还有HPV的感染等有一定的关系。但是也是这些因素综合作用的结果，也不是百分之百的强烈关联。除此之外，有更多的原因是未知的。例如患者可能有基础水平的基因突变，家族肿瘤遗传病史，还有后天的生活、工作、营养，经济状态等都有一定的关系，而阴茎癌的发生是这些因素综合作用的结果。
阴茎癌目前医学上已知的就是长期的包皮过长或者包茎，没有得到及时的治疗。这种包皮龟头炎症长期持续存在刺激局部，最终会导致恶变形成，引起阴茎癌的发生。当然，这个过程非常长，一般长达数十年。因此我们还是预防为主。有包皮过长或者包茎的，尽量在年轻的时候做包皮环切术，同时做好局部的卫生，就可以有效的预防。