发烧吃头孢克肟是否有效，取决于引起发烧的具体病因。发烧可由于感染性疾病和非感染性疾病引起，感染性疾病又可分为细菌感染、病毒感染，真菌感染、寄生虫感染等，头孢克肟主要用于治疗细菌性感染，如果患者是由于细菌感染引起的发烧，是可以吃头孢克肟的，而如果发烧是由于病毒、真菌、寄生虫等感染引起，吃头孢克肟是没有效果的，另外发烧还可以由于甲状腺功能亢进、肿瘤、结核，结缔组织疾病、风湿热等各种原因引起，这时吃头孢克肟也是没有效果的。
因此明确发烧的具体病因是非常关键的，建议及时进行血液分析、降钙素原、C反应蛋白，病毒全套、DNA全套等检查以进一步明确。